- Premio Extraordinario de Licenciatura en Junio de 1972.
- Premio Nacional Fin de Carrera de Ciencias Físicas, concedido el 24 de Noviembre de 1973.
- Premio Extraordinario de Doctorado (Universidad Autónoma de Barcelona). Concedido en Mayo de 1978.
- Overseas Fellow. Churchill College, Cambridge, Reino Unido. Nombrado en 1985.
- Miembro correspondiente de la Real Academia de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales.
- Miembro correspondiente de la Real Academia de Ciencias y Artes de Barcelona.
- Miembro de número de la Real Sociedad Bascongada de Amigos del País.
- Medalla de Oro del Gobierno Vasco, 1990.
- Fellow of the American Physical Society (FAPS) Nombrado en 1990.
- Miembro Consejo Científico de la Fundación BBV, 1990-2009
- Asesor de Ciencia y Tecnología. Vicepresidente de Iberdrola. 1993-2003
- Who is Who in the World. 1993 ; Dictionary of International Biography – 23d edition.
- Recipiente del Programa Profesores Visitantes Iberdrola 1993-2003
- Who is Who in Science and Engineering 1994.
- Five Thousand Personalities of the World 1994.
- Junta Rectora Cursos de Verano UPV/EHU 1994-
- Premio «Xabier María de Munibe» 1995.
- Miembro de la Comisión Trilateral 1996- 2015
- Miembro del Consejo de Excelencia de Eusko Ikaskuntza-Sociedad de Estudios Vascos. 1996-
- Elected Scientific Member of the Bosmiche Physical Society, Cornell University. 1996.
- Premio Euskadi de Investigación 1996.
- Premio «Dupont» de Ciencia 1996.
- Junta Directiva «Zientzia 21» para la creación de un Museo Interactivo de la Ciencia en San Sebastián.
- Premio Principe de Viana de la Cultura 1997.
- Premio Sociedad Grupo Correo 1997.
- «Vascos sin Fronteras», COINPASA 1997.
- Miembro del Comité Científico del Parque Científico de Barcelona.
- Premio Principe de Asturias de Investigación Científica y Técnica 1998.
- Medalla de oro de la UPV/EHU, 1998.
- Hijo Predilecto de la Villa de Isaba. 1998.
- Max Planck Physics Prize, 1998.
- Miembro del Consejo España- Estados Unidos (USA-Spain Council). 1999-2004
- Gran Cruz de la Orden Civil de Alfonso X el Sabio. 1998.
- Korrika. Omendua, 1999.
- Vasco Universal del año 1998.
- Dr of Science. Cambridge University. 1998.
- Miembro de honor y mérito Cofradía de la Anchoa, Donostia, Mayo 1999.
- Cofrade de honor de la Gaztambera, Elizondo Junio 1999.
- Premio de la Sociedad Española Materiales, 1999.
- Galardón Arbol de la Ciencia. CSIC. 1999.
- Medalla de Oro de la Ciudad de Donostia – San Sebastián 2000.
- Físico Honorario del COFIS (Colegio Oficial de Físicos de España), 2000.
- Doctor Honoris Causa. Universidad de Valladolid. Spain 2000.
- Fellow de la Asociación Americana para el Avance de la Ciencia (AAAS), FAAAS, Febrero 2001.
- Miembro del Patronato “El Instituto Europa de los Pueblos, Fundación Vasca”.
- Vocal del Consejo Rector del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), Abril 2001-2007
- Miembro Comisión Promotora del Plan Estratégico de la Ciudad de San Sebastián 2001
- Beneficiario del proyecto de Alto Rendimiento del Gobierno Vasco. Diciembre 2001.
- Miembro Patronato Fundación Rafael Escolá.
- Premio Iberdrola de Ciencia y Tecnología 2002.
- Premio Elegancia Intelectual 2002. Colegio de Sastres de España
- Homenaje Nafarroa Oinez 2002.
- Premio “Eusko Label Kalitatea” 2002.
- Medalla de Oro de la Real Sociedad Española de Física 2003.
- Premio “Manuel Irujo”. Fundación Irujo Etxea. Estella 2003.
- Miembro del Gran Consejo y Caballero de Honor de la Orden de la Oliva de Navarra y de la Tostada de Arroniz 2004.
- Confrade de Honor de la Cofradía Queso del Roncal, Roncal 2004.
- Profesor-Visitante distinguido en la Universidad Autónoma Metropolitana de México. 3-9 abril 2005.
- Premio Nacional Blas Cabrera de Física, Ciencia de Materiales y de la Tierra 2005.
- Premio Diario Vasco.com, categoría Investigación y Ciencia 2005.
- Socio de Honor BD/BN 2005
- Medalla de oro de Gipuzkoa 2006.
- Comité científico Nanogune 2006-
- Doctor Honoris Causa. Universidad Pública de Navarra (UPNA) 2008.
- Foreign Member of the Académie Royale des Sciences, des Lettres et des Beaux-Arts de Belgique 2009
- Miembro del Consejo Asesor Internacional del Campus de Excelencia de la Universidad de Oviedo 2010-
- Premio Manel Xifra Boada de Comunicación Científico-Técnica 2010
- Premio Sabino Arana 2011
- Consejero de Graphenea SA 2011-
- Consejero de IkerChem 2011- 2014
- Presidente Jurado de los Premios Príncipe de Asturias de Investigación Científica y Técnica 2012-
- Premio Liberpress Camins 2012
- Embajador Honorario Fundacional de San Sebastián 2012
- Premio HETEL Saria de compromiso con la Formación profesional 2012
- Doctor Honoris Causa por la Universidad Complutense de Madrid 2013
- Académico numerario electo de la Real Academia de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales 2014-
- Jurado de la VI Edición Premio NoviaSalcedo a la Excelencia en la Integración Profesional de los Jóvenes 2014
- Presidente del Jurado de la 9ª Edición de las Bolsas de Investigación del programa L’ORÉAL-UNESCO For Women in Science 2014
- Premio Teledonosti, 20 aniversario, de Ciencia e Innovación 2014
- Miembro del Patronato de la Fundación EDP
- Premio de la EPS (Sociedad Europea de Física) al DIPC en reconocimiento a su contribución científica y a sus actividades de divulgación
- Medalla de oro de Navarra 2016
- Doctor Honoris Causa por la Universidad de Aalto, Helsinki 2016
- Doctor Honoris Causa por la Universidad Primada de América Autónoma de Santo Domingo 2017 Miembro Honorífico de la EPS (European Physical Society) (2018) por “his outstanding achievements as a scientist in the field of Surface Physics, Attophysics, Interaction of charges and radiation with matter and Many-body Physics and for his contributions as an exceptional and tireless advocate of outreach, dissemination and public awareness of physics, notably the creation and development of Passion for Knowledge, which is a large-scale public outreach event in Donostia, Basque Country, promoting science as the driving force behind technological progress and the foundation of human culture”.
- Primer socio honorífico de la Federación Vasca de Empresas Junior 2019
- Miembro del Instituto Lombardo, Academia de Ciencias y Letras de Milán 2020
- V Premio a la innovación empresarial DonosiaINN 2020 al DIPC
- Premio NIE (Nafarroako Ikastolen Elkartea) 2023
- Conferencia solemne en la Reunión de Primavera de la Sociedad Alemana de Física (DPG) en Berlín 2024
- “Gallico de Oro” 2024 (otorgado por la Sociedad Gastronómica Napardi de Pamplona)